Aider à résoudre l’un des principaux défis de l’entomologie!
Les dommages que font les pucerons dans nos cultures maraîchères, surtout par la transmission de maladies, les placent parmi les plus importants insectes nuisibles. La lutte contre ces ravageurs diversifiés et abondants est difficile sans une compréhension de la taille des populations.
Nous cherchons à quantifier la diversité et l’abondance de dizaines de milliers d’insectes.
Le CÉROM (Centre de recherche sur les grains) et l’Université de Montréal recrutent un étudiant à la maîtrise pour développer des méthodes moléculaires haut débit de tri et d’identification de pucerons responsables de transmissions virales dans les cultures maraîchères du Québec.
MISE EN CONTEXTE
Les cultures maraîchères du Québec subissent d’importants dommages causés par deux virus majeurs : le Cucumber mosaic virus (CMV) et les Potyvirus. Plusieurs indices suggèrent que ces épidémies virales seraient liées à des populations exceptionnellement élevées de pucerons du soya.
Dans le cadre du projet, des collectes intensives de pucerons ont été réalisées dans des champs de cucurbitacées et de soya situés dans deux régions particulièrement touchées. En deux ans, environ 150 000 pucerons ont été capturés. Toutefois, l’identification précise des espèces demeure un défi, notamment pour celles du genre Aphis, qui comprend des espèces clés comme le puceron du melon (Aphis gossypii) et le puceron du soya (Aphis glycines) : 75 % des spécimens collectés appartiennent à ce genre.
OBJECTIFS
Le projet de maîtrise vise à (1) développer un protocole de biologie moléculaire (PCR) permettant l’identification de milliers de spécimens de pucerons responsables de la transmission du Cucumber mosaic virus et des Potyvirus, et (2) étudier la dynamique des populations des pucerons afin déterminer leur implication dans la transmission des virus.
PRINCIPALES TÂCHES
▪ Extraction d’ADN sur des lots de tailles variables (1 à 1 000 spécimens) et optimisation des protocoles PCR.
▪ Séquençage d’ADN Illumina et tri et identification bio-informatique des séquences.
▪ Calibration du nombre d’individus selon le nombre de reads et analyse des populations d’espèces dans la transmission des virus.
DÉTAILS DU PROJET
▪ Directeur de recherche : Colin Favret, professeur à l’Université de Montréal;
▪ Codirecteur : Sébastien Boquel, chercheur au CÉROM
▪ Cursus académique : l’étudiant doit s’inscrire au programme en sciences biologiques de l’Université de Montréal et respecter les exigences qui y sont rattachées.
▪ Milieu de recherche : Le travail se fera principalement à l’Université de Montréal / Institut de recherche en biologie végétale (au sein du Jardin botanique de Montréal) et au CÉROM (Saint- Mathieu-de-Beloeil). Le projet inclut la manipulation d’insectes, de la biologie moléculaire et de la bio-informatique. Le travail se déroulera exclusivement au laboratoire..
▪ Bourse offerte : 18 000 $/an financé par MITACS et le Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation, dans le cadre du programme Innovation bioalimentaire. D’autres bourses et contrats (e.g. démo en enseignement) sont disponibles.
▪ Durée du projet : 2 ans.
▪ Date de début : Janvier 2026 ou le plus tôt possible.
QUALIFICATIONS
▪ Baccalauréat en biologie, en agronomie, en entomologie, en bio-informatique, ou dans un domaine connexe.
▪ L’étudiant devra démontrer une connaissance adéquate de l’entomologie et de bonnes aptitudes en biologie moléculaire et bio-informatique.
PROFIL RECHERCHÉ
▪ Rigueur scientifique et consciencieux;
▪ Autonomie, polyvalence et débrouillardise;
▪ Dynamisme et créativité;
▪ Sens de l’organisation et gestion des priorités;
▪ Esprit d’analyse et de synthèse;
▪ Compétences en rédaction et en communication.
POSTULER
Faire parvenir (1) votre curriculum vitae, (2) une lettre de présentation d’une page maximum, (3) votre relevé de notes, et (4) les noms et coordonnées de deux personnes pouvant agir en tant que références, à l’attention de Sébastien Boquel (sebastien.boquel@cerom.qc.ca). La révision des candidatures débutera le 8 décembre et finira lorsque le poste sera pourvu. Pour toutes questions ou pour plus d’informations, n’hésitez pas à contacter Sébastien Boquel ou Colin Favret (colin.favret@umontreal.ca).